Став сёгуном, Ёритомо основал свой центр военного командования, известный как полевая ставка или палаточный штаб (бакуфу), в Камакура. Он конфисковал поместья семьи Тайра и их сторонников, назначил в каждую провинцию губернаторов/протекторов (сюго), а также поместных начальников (дзито), создав таким образом финансовую систему, позволяющую содержать регулярные военные силы и поддерживать их боеспособность.
Период правления военного правительства, основанного Ёритомо, получил название Камакурского сёгуната (1185-1333 гг). Система землевладения, при которой существовала следующая связь: владелец – управляющий – арендатор – работник, стала более военизированной. Члены новых объединений, контролируемые различными кланами, должны были практиковаться с использовании различных видов оружия. К тому же лидеры гарантировали себе привилегии, ставшие со временем нерушимыми.
После смерти Ёритомо в 1199 году власть Минамото перешла к семье Ходзё, члены которой ранее были вассалами Тайра. Они явили себя искусными государственными деятелями, реорганизовав порядок престолонаследия и правила избрания чиновников, также члены этой семьи перераспределили конфискованные земли, реформировали механизмы управления и сбора налогов, развили культуру и искусство, а также способствовали распространению школы Дзен.
Помимо этого Ходзё сплотили кланы для отражения монгольского нашествия в 1274 и 1281 годах, что сильно опустошило казну. Это повлекло очередную реформу: торговцам было запрещено требовать долги с воинского сословия; также чиновники присвоили себе земли, объявив себя их владельцами, а сильные землевладельцы расширяли свои поместья за счёт более слабых соседей.
В этот период смуты император Годайго попытался объединить недовольных феодалов против ставки в Камакура и в 1334 ему удалось в некоторой степени восстановить императорскую власть (не без помощи Такаудзи из клана Асикага). Однако на следующий год Такаудзи изгнал императора из Киото, посадил на трон его конкурента и установил свою диктатуру (сёгунат Асикага, 1336-1568 гг.)
Такие события повлекли за собой новый виток междоусобиц, когда Южная династия императора Годайго противостояла Северной династии марионеточного императора Такаудзи. В провинцияв в свою очередь возникали локальные очаги власти. В эту эпоху преданность каждого члена клана своему непосредственному начальству была лишь бледной тенью того, чем она стала позднее
Подробнееhttp://leit.ru/modules.php?name=Pages&pa=showpage&pid=440